就是葬在云居山上，也很分散。年长日久，连塔墓都找不到了。作为云居祖庭的看门人，虚云和尚自责于内心不安，所以请詹居士夫妇考虑可否用这笔款子改用于建筑云居山海会塔。复信寄出之后，很快收到詹居士夫妇的回信，告之同意虚云和尚的意见，并且又增寄5万元港币以为工程之用。新建海会塔工程随即开工，到1959年7月，海会塔建造竣工，虚云和尚很是高兴，特地用弟子供养的仪金请塑2尊地藏菩萨像，其中一尊就供奉于海会塔中。

1959年8月初(农历六月)，虚云和尚的病情加重。一天，真如禅寺住持性福率众职事前去探望虚云和尚。虚云和尚在感谢大家的好意之后，语重心长地将自己的后事做了交待：“我们有缘，相聚一处。承诸位发大心，数年间复兴云居道场，辛劳可感。但苦于世缘将尽，不能为祖师作扫除隶，有累诸位。倘我死后，全身要穿黄色衣袍。一日后入龛，在此牛棚之西山旁掘化身窑。火化之后，将吾骨灰，辗成细末，以油糖面粉做成丸果，放之河中，以供水族结缘。满吾所愿，感谢不尽!”大家听了都劝虚云和尚好好养病，长住弘法。虚云和尚对大家的安慰再次表示感谢，并告诉说：“我的世缘已尽，随缘去吧!”接着说了《辞世偈》，云：

虾恤蚁命不投水，吾慰水族身掷江。

冀诸受我供养者，同证菩提度众生。

又

请各法侣，深思熟虑。生死循业，如蚕自缚。

贪念不休，烦恼益苦。欲除此患，布施为首。

净参三学，坚持四念。一旦豁然，方知露电。

悟证真空，万法一体。无生有生，是波是水。

又

吁嗟我衰老，空具报恩心。
    宿债无时了，智浅业识深。
    愧无成一事，守拙在云居。
    诵子喫饰句，深愧对世尊。
    灵山会未散，护法仗群公。
    是韦天再世，振毗耶真风。
    自他一体现，咸仰金粟尊。
    中流作砥柱，苍生赖片言。
    末法众生苦，向道有几人。
    我负虚名累，子应觉迷津。
    佛国时欣慕，香光似近趋。
    谨留几句偈，聊以表区区。

或许是因为天气变暖，更加上香港弟子释宽航等人上山探望，到农历八月虚云和尚的病情有所减轻，精神好转，天气好的时候还能在侍者的搀扶下到天王殿前走走，与僧众冲壳子(系湖南方言，即“聊天”)。月内又收到越南宣圣法师的来信，询问虚云和尚的身体状况与云居山真如禅寺情况，虚云和尚当即口授，由侍者执笔写了回信。对于自己，虚云和尚感谢宣圣法师等人的关心，“惟老病不堪，旦暮幻景，殆将不久”。虚云和尚希望宣圣法师等人，“当各痛念生死事大，无常迅速，精进净业，勿空过光阴，勿负此人身!”从中我们可以看到虚云和尚对佛法的崇奉可以称得上是至死不渝，对自己的生死去留随缘而定，洒脱无比。对后学、对来者无不苦口婆心教导他们抓紧时间，认真修持，了脱生死。应当说这正是虔诚佛教徒的最后心声──慈悲度众。

1959年农历八月间，虚云和尚除口授回复越南宣圣法师的信，同时还对专程前来亲近自己、朝山礼祖的香港释宽航等人也多有开示。其中有以禅板为例，教诲弟子要“一个人做事的时候就要认真做去。做好之后，就要像这块竹板一样空无所有。”虚云和尚的这番开示，与《金刚经》所说“应无所住”同出一辙，而且更为形象，更为具体，因而给在场的弟子们留下了终生难忘的印象。

1959年农历九月初六，在潇潇秋风中，虚云和尚得知北京传来李济深先生逝世的噩耗，痛苦万分，悲怆地喊了一声：“任潮(即李济深的字)!你怎么先走了，我也要去了。”而后，竟长时间说不出话来。这一句悲惨的话语，道出了虚云和尚对李济深先生的一片深情。早在1933年11月，李济深与蒋光鼐、蔡廷锴等人在福建宣布反蒋抗日，组织“中华共和国人民政府"时，虚云和尚就与李济深交往密切。