全体僧众每日礼忏两个小时，为无辜百姓和为国捐躯烈士们的亡灵诵经超度。同时，虚云和尚又号召大家减免晚餐，以节省粮食，贡献给国家赈灾济困。虚云和尚的建议自然得到僧众的赞同。于是，虚云和尚亲自主法拈香，在南华禅寺大雄宝殿和法堂启坛，举办荐亡息灾法会。除了南华禅寺常住僧众和近千名新戒上殿礼佛拜忏外，自马坝、韶关甚至从广州而来随喜的众弟子也有数百人。因而，法会规模空前，又一次轰动了粤北一带。

民国二十九年（1940）春，时局仍然动荡不安，但虚云和尚却还是想方设法如期在南华禅寺启坛传授三坛大戒。就在传戒结束之时，消息传来，广州沦陷。同时，北面也不断传来坏消息。从南、北两端逃亡而来的僧众和难民日渐增多。南华禅寺内外，除大雄宝殿外到处都住满了人，可是逃亡而来的人们还是源源不断地来。面对这些僧众和难民，虚云和尚很是难过，虑及南华禅寺已经是人满为患，于是决定率众广泛联络有关人士募集资金，在维持南华禅寺修复工程的同时，着手修复坐落于韶关市内的大鉴寺，以之为南华禅寺下院，安顿逃难的僧众和难民。此后不久，虚云和尚又主持修复坐落于曲江县濛浬村的月华寺，也用来安顿逃难的僧众和难民。就这样，在极端困难的情况下，虚云和尚千方百计使南华禅寺、大鉴寺、月华寺广开海单，接受、安顿逃难的僧众和难民。这正是虚云和尚全力实践佛门“慈悲为怀，普度众生”之宗旨，行善救苦救难的行动，意义非凡。

也就在民国二十九年（1940）前后，虚云和尚在主持南华禅寺、大鉴寺、月华寺等安顿逃难的僧众和难民的同时，带头率领诸寺常住僧众节衣缩食，除维持正常生活外，连南华禅寺的修复工程也大多暂时停了下来，以节约经费，救助难民。有的工程一时无法停下，虚云和尚则率众尽力维持进行，自己以百余岁高龄亲自参加挑泥、抬木头等劳动，以节省雇用民工的费用来救助难民。非仅如此，到民国三十年（1941），虚云和尚看到当时全国抗日形势严竣，生活在水深火热中的民众艰苦难熬，饥民饿殍到处可见，悲心常持，慈情更浓，主动将近两年来众皈依弟子和信众护法供养果资二十多万元捐出，交给广东省政府，用于赈济。此举得到当局官员和民众的好评。与此同时，虚云和尚率大鉴寺僧众开办毛巾厂，自己动手，加工毛巾，以增加常住收入，维持僧众和难民生活。此举虽然收入不是很多，影响也有限，但至今却仍为人们评之为在中国佛教史上，“这是工禅结合的开始。”

四、主法山城，宏论震惊四众

民国三十一年（1942）冬，应国民政府主席林森、考试院院长居正等人的邀请，由屈映光、张子廉等人为代表前来迎请，虚云和尚从南华禅寺出发，从广东入广西，经贵州而来到重庆，入住于狮子岩山慈云寺。次年元月，林森、屈映光、何应钦等人亲自护法，由虚云和尚登坛主法，在慈云寺和华严寺设坛，启建“护国息灾大法会道场”。虚云和尚以百余岁高龄，亲自率领数百名僧人虔修礼忏，祈佛祖庇护息灾除难，以保众生平安，祝愿抗日战争早日取得胜利，国泰民安。法会会期四十九天，每日参加礼忏的僧众都在百人以上，随喜四众弟子则有数万人先后参加，加之林森、屈映光等政要人物相继莅寺拈香礼佛。因而，法会规模空前，更是引起新闻界和广大民众的关注，前来观看和礼拜虚云和尚的信众每日都有数千人。法会的隆重举行成为当时重庆的一件盛事而传颂四方。

在重庆举办息灾减难大法会期间，虚云和尚于民国三十二年（1943）元月十日上书林森，告之法会进展的盛况，并重申来渝之前议定的关于修法应施行的五件事，即：大赦，增广赈济难民，禁止屠宰牲畜，提倡茹素和放生，减轻赋税，保护寺院及免除僧役。对虚云和尚的请求，林森立即做了批示，同意所请。这些事件的实施，在当时说来确非小事，在教内外都产生了不小的影响。

在重庆主持法会期间，虚云和尚还在慈云寺多次举行皈依法会，收受皈依弟子数千人。同时，分别于民国三十二年（1943）元月十七日、十八日在慈云寺为信众开示。在开示中虚云和尚强调作为佛门皈依弟子，今后就要奉守佛祖遗教，认真修持，确信“世间万事如幻”，人的一生所作所为，实际和蜜蜂酿蜜、春蚕作茧是一样的。